بررسی الگوی ترجیح کدونی و ارتباط آن با ژن‌هایی با بیان متفاوت در بین دو جمعیت گاوهای خالص و آمیخته سیستانی و مونت‌بیلیارد

بتول اصغری اسفدن؛ غلامرضا داشاب؛ محمدحسین بنابازی؛ محمد رکوعی

دوره 22، شماره 2 ، تیر 1399، ، صفحه 187-198

چکیده
  هدف از پژوهش حاضر، بررسی الگوی ترجیح کدونی و ارتباط آن‌ها با بیان ژن برای ژن‌های با بیان متفاوت در بین نژادهای خالص و آمیخته سیستانی و مونت‌بیلیارد بود. در این مطالعه، از نتایج تجزیه بیان ژن افتراقی با استفاده از فن‌آوری RNA-Seq مربوط به نژادهای خالص و آمیخته سیستانی و مونت‌بیلیارد (دو تیمار و هر تیمار دو تکرار بیولوژیک) استفاده شد. ...  بیشتر

شناسایی LncRNAهای مرتبط با رشد عضله سینه مرغ بوسیله روش RNA-seq

سُید نادر آلبوشوکه؛ محمدرضا بختیاری زاده

دوره 21، شماره 2 ، تیر 1398، ، صفحه 165-180

چکیده
  هدف از این آزمایش بررسی و شناسایی RNAهای غیررمزکننده بلند (lncRNAs) مرتبط با عضله اسکلتی مرغ بومی اصفهان و جوجه تجاری راس 708 بود. پس از استخراج RNA از چهار نمونه‌ عضله سینه در سن 28 روزگی، توالی‌یابی جفتی با استفاده از پلاتفرم illumine Hiseq 2000 انجام شد. برای هم­ترازی خوانش‌ها با ژنوم مرجع مرغ اهلی، از نرم­افزار Hisat2 و جهت سرهم‌بندی رونوشت­ها ...  بیشتر

تجزیه و تحلیل پروموتر ژن‏های مؤثر در تعادل منفی انرژی در گاوهای شیری

زهره مزدوری؛ محمدرضا بختیاری زاده

دوره 18، شماره 1 ، فروردین 1395، ، صفحه 13-26

چکیده
  این تحقیق به‌منظور درک بهتر سازوکارهای تنظیمی بیان ژن‏های مربوط به تعادل منفی انرژی انجام شد. ژن‏های با بیان بالا در تعادل منفی انرژی با استفاده از داده‏های ریزآرایه و RNA-seq شناسایی و توالی‏های پروموتری آنها برای شناسایی فاکتورهای رونویسی جدید در ارتباط با این مراحل تجزیه و تحلیل شدند. افزون بر این، از پایگاه اطلاعاتی STRING برای ...  بیشتر