برآورد عوامل غیر ژنتیکی و ژنتیکی موثر بر صفت بقاء در گوسفند زندی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانش آموخته دوره کارشناسی ارشد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

2 دانشیار گروه علوم دامی و بیوانفورماتیک دانشگاه زابل، تخصص: ژنتیک و اصلاح نژاد دام/ ژنتیک کمی/ اصلاح نژاد گاو شیری/ شبیه‌سازی/ ژنتیک جمعیت

3 دانشیار، گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل

4 مربی، کارشناس مرکز اصلاح نژاد و بهبود تولیدات دامی کشور، کرج

5 استادیار پژوهشکده دام های خاص، دانشگاه زابل

چکیده

این تحقیق با هدف برآورد عوامل محیطی موثر بر بقاء و برآورد پارامترهای ژنتیکی بقاء از یک تا آخرین روز رکوردبرداری در گوسفند زندی انجام شد. اطلاعات مورد استفاده شامل رکوردهای بقاء 9558 بره متولد شده از 273 قوچ و 2328 میش بود که توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور در طول 25 سال (1366 تا 1390) جمع‌آوری شده بود. عوامل مؤثر بر بقاء و خطر حذف توسط دو بسته نرم‌افزاری Survival و cmprsk برآورد شدند. برآورد مؤلفه‌های واریانس صفت بقاء با استفاده از توزیع ‌‌نمایی بر مبنای داده‌های سانسور شده توسط مدل با اثر افزایشی (مدل 1) و مدل با اثر افزایشی و محیط دائم مادری (مدل 2) تحت رویکرد بیزین و تکنیک نمونه‌گیری گیبس انجام گرفت. تعداد 1000000 نمونه با دوره سوخته 100000 و فاصله نمونه گیری 75 برای برآورد مؤلفه‌های واریانس استفاده شد. نتایج نشان داد، که اثرات عوامل سال تولد، ماه تولد، وزن تولد، نوع تولد، جنس بره (p<0.001) و سن مادر (p< 0.01) بر صفت بقا معنی دار بود. وراثت پذیری مستقیم صفت بقا درمدل 1 و 2 به ترتیب 0.184(0.136-0.234) و 0.162( 0.120- 0.210) بود. نسبت واریانس محیط دائمی مادری به واریانس فنوتیپی 0.046( 0.031- 0.056) بود. براساس نتایج این تحقیق، بهبود ژنتیکی بقا بره های زندی توسط انتخاب ژنتیکی امکان پذیر بئده و مدیریت بهتر عوامل محیطی در کاهش خطر حذف بره های این نژاد موثر می باشد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Estimation of non-genetic and genetic effects for survival trait in Zandi sheep

نویسندگان [English]

  • Ali Vojdan Hassan Kiyadeh 1
  • Mohammad Rokouei 2
  • Gholam Reza Dashab 3
  • Ahmad Reza Seyedalian 4
  • Hadi Faraji- Arough 5
1 Postgraduate of Master of Science, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran
3 Assistant professor in the Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran
4 Animal Breeding Center of Iran, Karadj, Iran
5 Research Center of Special Domestic Animals, University of Zabol, Zabol, Iran
چکیده [English]

This research was conducted with the aim of estimation of environmental factors affecting survival and estimate the genetic parameters survival from 1 to the last recording date in Zandi sheep. The survival records of 9558 Zandi sheep from 273 rams and 2328 ewes collected by Animal Breeding Center of Iran during the 25 years (1987 to 2011) were used in the analysis. The effective factors on survival and culling risk were estimated by Survival and cmprsk package. Estimation of variance components was performed by using of exponential distribution for censored dates by the fitting of model with additive genetic effect (model 1) and joint additive genetic and maternal permanent environmental of effects (model 2) under Bayesian approach and Gibbs sampling. A total of 1000000 samples with a burn-in of 100000 and a sampling interval of 75 were generated to estimate the posterior distribution of variance components. The results showed that year, month, birth weight, type birth, sex (P<0.001) and dam age (p<0.01) had significant effect on survival trait. the direct heritability of survival trait using models 1 and 2 was 0.184( 0.136-0.264) and 0.162( 0.120-0.202), respectively. the proportion of permanent variance to phenotypic variance was  0.046( 0.063- 0.031). According to the results of this study, genetic improvement of survival trait in zandi lamb is possible by genetic selection and the culling risk reduction is effective via management of environmental factors.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Censored data
  • Culling risk
  • Genetic parameter
  • Gibbs sampling
  • heritability
  • Zandi sheep
سی‌سختی د، وطن‌خواه م، میرزایی ح ر، یوسف‌الهی م و حسین‌پور مشهدی م (1388) برآورد برخی عوامل محیطی و پارامتر‌های ژنتیکی زنده‌مانی بره‌های لری‌بختیاری. نشریه علوم دامی (پژوهش و سازندگی). (84): 66-70.
2- ملاعبدالکریمی م، رشیدی ا و عسگری جعفر آبادی ق (1393) برآورد پارامترهای ژنتیکی زنده­مانی در بره­های زندی با استفاده از مدل­های حیوانی، پدری و آستانه­ای. نشریه علوم دامی (پژوهش و سازندگی). 105 (4): 27- 34.
3- وجدان حسن کیاده ع، رکوعی م، داشاب غ ر و سید علیان ا ر (1395) ارزیابی ژنتیکی صفت بقاء در گوسفند بلوچی با روش نمونه­گیری گیبس. مجله علوم دامی ایران. 47(3): 453- 461.
4- وطن­خواه م (1391) مطالعه تابع توزیع زنده­مانی در بره­های لری بختیاری از تولد تا سن یکسالگی. نشریه علوم دامی (پژوهش و سازندگی). 95(2): 21-26.
5. Barazandeh A, Molaei MS, Vatankhah M and Ghavi Hossein-Zadeh N (2012) Lamb survival analysis from birth to weaning in Iranian Kermani sheep. Tropical Animal Health Production 44: 929-934.
6. Borg RC (2007) Phenotypic and genetic evaluation of fitness characteristics in sheep under a range environment. Blacksburg: Virginia Polytechnic Institute and State University, Ph.D. Dissertation.
7. Brien FD, Hebart ML, Smith DH, Hocking Edwards JE, Greeff JC, Hart KW, Refshauge G, Bird-Gardiner TL, Gaunt G, Behrendt R, Robertson MW, Hinch GN, Geenty KG and Van der Werf JHJ (2010) Opportunities for genetic improvement of lamb survival. Animal Production Science 50:1017–1025.
8. Dwyer CM and Morgan CA (2006) Maintenance of body temperature in the neonatal lamb: Effects of breed, birth weight, and litter size. Journal of Animal Science 84: 1093-1101.
9. Everett-Hincks JM, Blair HT, Stafford KJ, Lopez-Villalobos N, Kenyon PR and Morris ST (2005) The effect of pasture allowance during pregnancy on maternal behavior and lamb rearing performance in highly fecund ewes. Livestock Production Science 97: 253–266.
10. Fine JP and Gray RJ (1999) A proportional hazards model for the subdistribution of a competing risk. Journal of the American Statistical Association 94(446):496-509.
11. Ghafouri- Kesbi F and Eskandarinasab MP (2008) An evaluation of maternal influences on growth traits the Zandi sheep of Iran as an example. Journal of Animal and Feed Science 17:519-529.
12. Ghavi Hossein-Zadeh N, Noori R, Shadparvar AA (2018) Genetic analysis of longevity and lamb survival from birth to yearling in Moghani sheep. Journal of Applied Animal Research 46(1):1363 -1369.
13. Hadfield JD (2010) MCMC methods for multi-response generalized linear mixed models: the MCMCglmm R package. Journal of Statistical Software 33(2):1-22
14. Lumley T and Therneau T (2004) The survival package. R News 4(1):26-8.
15. Mandal A, Prasad H, Kumar A, Roy R and Sharma N (2007) Factors associated with lamb mortalities in Muzaffarnagari sheep. Small Ruminant Research 71:273-279.
16. Riggio V, Finocchiaro R and Bishop SC (2008) Genetic parameters for early lamb survival and growth in Scottish Blackface sheep. Journal of Animal Science 86: 1758-1764.
17. Sawalha RM, Conington J, Brotherstone S and Villanueva B (2007) Analyses of lamb Survival of Scottish Blackface sheep. Journal of Animal Science 1: 151- 157.
18. Scales GM, Burton RN and Moss RA (1986) Lamb mortality, birth weight, and nutrition in late pregnancy. New Zealand Journal of Agricultural Research 29: 75–82.
19. Slee J, Alexander G, Bradley LR, Jackson N and Stevens D (1991) Genetic aspects of cold resistance and related characters in newborn merino lambs. Australian Journal of Experimental Agriculture 31:175–182.
20. Smith BJ (2007) Boa: An R package for MCMC output convergence assessment and posterior inference. Journal of Statistical Software 21(11): 1-37.
21. Smith GM (1977) Factors affecting birth weight, dystocia and preweaning survival in sheep. Journal of Animal Science 44: 745-753.
22. Southey BR, Rodriguez-Zas SL and Leymaster KA (2001) Survival Analysis of lamb mortality in a terminal sire composite population. Journal of Animal Science 79: 2298- 2306.
23. Vatankhah M (2013) Estimation of the genetic parameters for survival rate in Lori-Bakhtiari lambs using linear and Weibull proportional hazard models. Journal of Agricultural Science and Technology 15(6):1133-1143.
24. Vatankhah M and Talebi MA (2009) Genetic and non-genetic factors affecting mortality in Lori-Bakhtiari lambs. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences 22(4): 459-464.