نوع مقاله : مقاله پژوهشی
نویسندگان
1 دانش آموخته دوره کارشناسی ارشد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل
2 دانشیار گروه علوم دامی و بیوانفورماتیک دانشگاه زابل، تخصص: ژنتیک و اصلاح نژاد دام/ ژنتیک کمی/ اصلاح نژاد گاو شیری/ شبیهسازی/ ژنتیک جمعیت
3 دانشیار، گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل
4 مربی، کارشناس مرکز اصلاح نژاد و بهبود تولیدات دامی کشور، کرج
5 استادیار پژوهشکده دام های خاص، دانشگاه زابل
چکیده
این تحقیق با هدف برآورد عوامل محیطی موثر بر بقاء و برآورد پارامترهای ژنتیکی بقاء از یک تا آخرین روز رکوردبرداری در گوسفند زندی انجام شد. اطلاعات مورد استفاده شامل رکوردهای بقاء 9558 بره متولد شده از 273 قوچ و 2328 میش بود که توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور در طول 25 سال (1366 تا 1390) جمعآوری شده بود. عوامل مؤثر بر بقاء و خطر حذف توسط دو بسته نرمافزاری Survival و cmprsk برآورد شدند. برآورد مؤلفههای واریانس صفت بقاء با استفاده از توزیع نمایی بر مبنای دادههای سانسور شده توسط مدل با اثر افزایشی (مدل 1) و مدل با اثر افزایشی و محیط دائم مادری (مدل 2) تحت رویکرد بیزین و تکنیک نمونهگیری گیبس انجام گرفت. تعداد 1000000 نمونه با دوره سوخته 100000 و فاصله نمونه گیری 75 برای برآورد مؤلفههای واریانس استفاده شد. نتایج نشان داد، که اثرات عوامل سال تولد، ماه تولد، وزن تولد، نوع تولد، جنس بره (p<0.001) و سن مادر (p< 0.01) بر صفت بقا معنی دار بود. وراثت پذیری مستقیم صفت بقا درمدل 1 و 2 به ترتیب 0.184(0.136-0.234) و 0.162( 0.120- 0.210) بود. نسبت واریانس محیط دائمی مادری به واریانس فنوتیپی 0.046( 0.031- 0.056) بود. براساس نتایج این تحقیق، بهبود ژنتیکی بقا بره های زندی توسط انتخاب ژنتیکی امکان پذیر بئده و مدیریت بهتر عوامل محیطی در کاهش خطر حذف بره های این نژاد موثر می باشد.
کلیدواژهها
عنوان مقاله [English]
Estimation of non-genetic and genetic effects for survival trait in Zandi sheep
نویسندگان [English]
- Ali Vojdan Hassan Kiyadeh 1
- Mohammad Rokouei 2
- Gholam Reza Dashab 3
- Ahmad Reza Seyedalian 4
- Hadi Faraji- Arough 5
1 Postgraduate of Master of Science, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran
2
3 Assistant professor in the Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran
4 Animal Breeding Center of Iran, Karadj, Iran
5 Research Center of Special Domestic Animals, University of Zabol, Zabol, Iran
چکیده [English]
This research was conducted with the aim of estimation of environmental factors affecting survival and estimate the genetic parameters survival from 1 to the last recording date in Zandi sheep. The survival records of 9558 Zandi sheep from 273 rams and 2328 ewes collected by Animal Breeding Center of Iran during the 25 years (1987 to 2011) were used in the analysis. The effective factors on survival and culling risk were estimated by Survival and cmprsk package. Estimation of variance components was performed by using of exponential distribution for censored dates by the fitting of model with additive genetic effect (model 1) and joint additive genetic and maternal permanent environmental of effects (model 2) under Bayesian approach and Gibbs sampling. A total of 1000000 samples with a burn-in of 100000 and a sampling interval of 75 were generated to estimate the posterior distribution of variance components. The results showed that year, month, birth weight, type birth, sex (P<0.001) and dam age (p<0.01) had significant effect on survival trait. the direct heritability of survival trait using models 1 and 2 was 0.184( 0.136-0.264) and 0.162( 0.120-0.202), respectively. the proportion of permanent variance to phenotypic variance was 0.046( 0.063- 0.031). According to the results of this study, genetic improvement of survival trait in zandi lamb is possible by genetic selection and the culling risk reduction is effective via management of environmental factors.
کلیدواژهها [English]
- Censored data
- Culling risk
- Genetic parameter
- Gibbs sampling
- heritability
- Zandi sheep