پروین شریعتی گزگزاره؛ علی اکبر مسعودی؛ رسول واعظ ترشیزی؛ علی رضا احسانی؛ زینب موسویان
دوره 22، شماره 2 ، تیر 1399، ، صفحه 199-209
چکیده
هدف از این مطالعه بررسی پروفایل بیان ژن در بافت تخمدان گوسفندان شال با استفاده از دادههای توالییابی RNA بود. برای این منظور، تخمدانهای پنج رأس گوسفند شال بعد از همزمانسازی فحلی جداسازی و RNA آنها با استفاده از فناوری Illumina Hiseq 4000 توالییابی شد. بهطور میانگین، دادههای بهدست آمده از توالییابی شامل 26638311 جفت خوانش با نرخ ...
بیشتر
هدف از این مطالعه بررسی پروفایل بیان ژن در بافت تخمدان گوسفندان شال با استفاده از دادههای توالییابی RNA بود. برای این منظور، تخمدانهای پنج رأس گوسفند شال بعد از همزمانسازی فحلی جداسازی و RNA آنها با استفاده از فناوری Illumina Hiseq 4000 توالییابی شد. بهطور میانگین، دادههای بهدست آمده از توالییابی شامل 26638311 جفت خوانش با نرخ نقشهیابی منحصر به فرد 81/08 بود. نتایج حاصل از آنالیزهای بیوانفورماتیکی، بیان 21085 ژن را در بافت تخمدان گوسفندان شال نشان داد که از این تعداد 15087 ژن دارای میانگین بیان بالاتر از 10 بودند. تجزیه و تحلیل عملکردی ژنها، معنیداری (p<0/05) بود 162 عبارت GO شامل 41 فرایند بیولوژیکی، 46 عملکرد مولکولی و 75 جز سلولی را نشان داد. همچنین آنالیز مسیرهای KEGG ، 149 مسیر معنی دار ( p <0/05) را شناسایی کرد که مهم ترین آن ها مسیر پیام رسانی استروژن، مسیر پیام رسانی TGF-beta و تقسیم میوز اووسیت بود. بررسی بیان ژن های عمده برای دوقلوزایی و تولیدمثل، بیان بالایی برای ژن های INHA, INHBA,BMPR1B را نشان داد و ژن INHA یک فاکتور پاراکرین مهم در فولیکول های تخمدان جز 10 ژن با بالاترین میانگین بود. همچنین ژن های FSHR, ESR1 و ESR2 بیان متوسط و ژن های GDF9, BMP15 و PRLR بیان پایینی در نمونه ها نشان دادند. در این مطالعه برای اولین بار ترنسکریپتوم بافت تخمدان میش های شال با استفاده از فناوری RNA-seq بطور جامع بررسی شد و این مطالعه می تواند پایه ژنتیکی مفیدی برای شناخت بهتر ژن ها و فرایندهای درگیر در تولیدمثل گوسفندان شال فراهم کند.
سجاد پزشکی نجف آبادی؛ علی اکبر مسعودی؛ ابوالفضل شیرازی؛ پروین شریعتی
دوره 18، شماره 4 ، دی 1395، ، صفحه 679-686
چکیده
فاکتورهای نسخه برداری با اتصال به نواحی پروموتوری ژنها و تنظیم بیان آنها نقش مهمی در کنترل باروری حیوانات دارند. در این مطالعه، بیان ژنهای nobox، ovol1 و zp3 که از ژنهای کاندید درگیر در مسیرهای تنظیمی ژنها میباشند، در دو گروه چند قلوزا و تک قلوزای گوسفندان شال بررسی شد. تعداد شش رأس گوسفند با توجه به شجره آنها از گله اصلاح شده ...
بیشتر
فاکتورهای نسخه برداری با اتصال به نواحی پروموتوری ژنها و تنظیم بیان آنها نقش مهمی در کنترل باروری حیوانات دارند. در این مطالعه، بیان ژنهای nobox، ovol1 و zp3 که از ژنهای کاندید درگیر در مسیرهای تنظیمی ژنها میباشند، در دو گروه چند قلوزا و تک قلوزای گوسفندان شال بررسی شد. تعداد شش رأس گوسفند با توجه به شجره آنها از گله اصلاح شده ایستگاه شال قزوین جدا شده و برای این تحقیق مورد استفاده قرار گرفتند. پس از همزمان سازی فحلی، گوسفندان با روش بیهوش عمومی جراحی شده و فولیکولهای بالغ تخمدان با روش آسپیره کردن استحصال شدند. پس از استخراج RNA، cDNA نمونهها ساخته شد. برای بررسی بیان ژنهای فوق، آغازگرهای اختصاصی هر ژن طراحی شده و سپس با استفاده از روشReal-Time PCR و با بکارگیری روش ΔΔCt بیان نسبی ژنها سنجیده شد. مقایسات بین میانگین ها، با استفاده از رویه آماری T-Test انجام شد. همچنین با استفاده از نرمافزار BDGP نواحی پروموتوری و فاکتورهای نسخهبرداری ژنهای مورد مطالعه بررسی شد. بیان ژنهای nobox و ovol1 در گروه حیوانات چندقلوزا، معنیدار بود (P